海洋药物实验室有三组中央实验台、一组边台和三台通风柜，主要设备有冷冻干燥器、冷冻离心机以及10台套旋转蒸发仪，可同时容纳30人开展实验。主要实验项目为：海洋天然产物、海洋植物、海洋细菌、真菌、微生物的提取分离实验，以及天然产物生物活性测试实验。